新冠病毒進化研究有了新視角
科技日報訊 (記者劉霞)美國和瑞士科學家在生物預印本網(wǎng)站(bioRxiv)提交論文稱,他們利用已經(jīng)公開的數(shù)百萬個新冠病毒的基因組序列,以前所未有的方式對其進化情況開展了研究,揭示了新冠病毒為了存活必須處于特定狀態(tài)且能耐受變化的基因位點。這一發(fā)現(xiàn)有助科學家開發(fā)出靶向新冠病毒某些蛋白的新型藥物。
研究人員指出,通過監(jiān)測新冠病毒變異株的生長情況,他們有可能識別出一些對病毒生長有利的病毒核糖核酸(RNA)單個堿基字母的突變。這些堿基字母與構成病毒基因主干的四個堿基有關,但這些單字母突變只是所有可能出現(xiàn)突變的一小部分。
新冠病毒每個RNA單字母可能平均突變了15000次。數(shù)以百萬計新冠病毒測序樣本為研究人員提供了評估這些自然實驗結果的方法。
在最新研究中,美國弗雷德·哈欽森癌癥中心和瑞士巴塞爾大學研究人員使用數(shù)百萬個已公開的新冠病毒基因組序列,首先統(tǒng)計了已知所有單字母突變均為中性的位點發(fā)生突變的頻率,因為這不會導致蛋白質序列發(fā)生任何變化,所以得到的結果會指出在不影響病毒適應性的情況下,任何位點發(fā)生突變的頻率。然后,他們將每個位點觀察到的突變數(shù)量與預期數(shù)量進行比較,并將結果映射到新冠病毒所有蛋白上,以揭示病毒要生存并傳播,哪些位點必須處于特定狀態(tài),哪些位點可以耐受變化。
研究人員稱,這一發(fā)現(xiàn)有助于科學家開發(fā)出靶向新冠病毒某些蛋白的新型藥物,這些蛋白通常不易通過變異來逃避現(xiàn)有藥物的攻擊。